美国高中申请日本大学吗？
先简单解答一下题主的问题。 答主现在东京大学研究生在读，当年也是通过EJU(现改名为JLPT)考试考进东大的。 因为日本是应试教育，所以考试制度比较统一。 在日本所有大学里，作为外国人留学生想考的难度顺序的话（从难到易）： 一流名校（中坚九校）： 东大、北大、清华、复旦、上交、南大、人大、北师大、浙大； 中游名校： 西工大、武大、中山、厦大、央财； 末流名校： 北外、海大、对外经贸、华东师大、西南财大、中南财大； 二流学校： 东北大学、西北工业大学、郑州大学、湖南大学、云南大学、贵州大学……等等。 (PS. 此处排名不分先后，只是按照记忆写的，可能不太准确。)
虽然日本有37所国立大学，但只有其中的一部分接受外国留学生的报考，而且这些学校又分成A类院校和B类院校，中国学生一般能报的B类院校多一点。 A类院校要求申请者必须要有日语能力证书N1或者N2，且高考成绩达到了一本线以上才能报考；而B类院校对日语能力不要求，而且只要达到二本线以上即可报考。 但是！不管是哪类学校，都要求提供EJU成绩，且必须包含英语托福或雅思成绩。 另外，除了一流的名校要求的EJU分数比较高以外，其余学校的EJU分数都不是很高，大概在650-700之间。 所以如果打算走日本留学路线的话，建议题主在高三时就把EJU给考了。 因为这是一份有效期为五年的考试成绩，在申请日本的大学乃至研究生都有用。
至于题主说的美国高中毕业申请日本大学的事情，我不是很了解，因为没接触过这样的案例。 但就美国高中毕业生申请英国本科以及韩国读研来说一点看法。 从英国大学录取的中国学生来看，除了清华北大等部分顶尖高校的学生会有中国学生被牛津剑桥选上的，其他大多数985/211学校出来的学生，申请到的最好的学校也就是爱丁堡大学而已。
而英国大学对于美高学生是存在歧视的，因为在美国读完高中，再申请英国大学，这个套路让英国校方感到担忧，因为不知道该学生究竟是准备在英国还是在美国发展。 无论是从中国高中生申请英国本科的案例来，还是从英美本科联申的案例来看，通常情况都是中国人选择了英国，而没有选择美国。
韩国的硕士相对容易一些，因为韩语语言优势在中国大陆是没有优势的，大部分韩流大学的中国人都是朝鲜族的学生。 当然，如果题主打算去韩国读硕士，又是完全没问题的，语言关可以用韩语课程解决。